Reconstrucción filogenética, filogeografía, biogeografía, mastozoología.
Mi línea de investigación está orientada al estudio de la sistemática molecular en diversos taxa, aunque de preferencia en mamíferos sudamericanos. Asimismo, me interesa conocer los principios y procesos que gobiernan las distribuciones de linajes genealógicos, área que compete a la filogeografía. Dentro de esta última aproximación el Laboratorio de Biología Evolutiva a mi cargo se ha orientado a estudios filogeográficos relacionados con la dinámica del Pleistoceno en Chile, y los efectos que fenómenos históricos tales como las últimas glaciaciones produjeron en la biogeografía y evolución de diversos taxa de vertebrados. En este sentido, nuestros últimos proyectos de investigación han estado centrados en estudios filogeográficos de pequeños mamíferos y vertebrados del Altiplano, el Desierto costero de Chile y región Mediterránea de Chile, así como de la Patagonia.