1. Clasificación de ecosistemas
La línea de investigación se centra en el desarrollo de tipologías de clasificación de la vegetación y de los bioclimas de Chile a distintas escalas espaciales. A través del proyecto Sinopsis bioclimática y vegetacional de Chile desarrollada junto a Federico Luebert, se ha generado una propuesta de clasificación de los ecosistemas terrestres de Chile, presentada el año 2006 y con una segunda edición el año 2017. Esta propuesta ha sido ampliamente utilizada en distintos trabajos científicos en aplicaciones de botánica, ecología y conservación de la biota en Chile y el extranjero.
2. Planificación sistemática para la conservación
Se busca la identificación de zonas prioritarias para complementar la red de protección de áreas públicas y privadas en Chile. Para esto, se utilizan distintas aproximaciones de análisis, aplicando herramientas de análisis espacial e información ambiental y socio-ecológica, obtenida tanto en terreno como de forma indirecta.
3. Modelos de distribución de especies
Las técnicas de modelos de distribución de especies o modelos de nicho ecológico. Buscan la identificación de la distribución espacial de especies y ecosistemas. Para esto se utilizan variables ambientales y registros de presencia, las que mediante técnicas estadísticas son relacionadas y permiten proyectar la distribución en el espacio geográfico y ambiental. Los modelos de distribución son utilizados para la caracterización de la distribución espacial, proyección pasada y futura, transformándose en herramientas de análisis esenciales para evaluar el impacto del cambio climático y explicar patrones biogeográficos.